联军被击败，玉努斯汗北回伊犁，哈麻海达尔回阿克苏，南疆南北由黑麻·海答和阿癿乞治。

    玉努斯汗公元1487病死塔，哈木塔继位。统治版图仅限塔和塔拉斯等汗国西区，外伊犁和北疆东疆等由其兄阿黑麻汗统治，南疆也义归顺。

    玉努斯汗死，帖木朝乌·沙黑·米咱和速檀·阿黑麻·米咱兄(皆为米咱·速檀卜撤因)便妄图从汗夺回塔城。哈木率军击，仅收复乌图城，并且击败了乌·沙黑·米咱攻。

    甘失败速檀·阿黑麻·米咱又复率15万军征讨塔城，哈木率军迎战。速檀·阿黑麻米咱辖沙亦乩汗(即阿海汗孙)反叛并降附了哈木汗，导致速檀·阿黑麻米咱彻底失败。

    ，阿黑麻汗统治东察合台汗国势，1487和1493东攻打哈密，迫使撤哈密。北方则军瓦剌，从额尔齐斯河北区赶瓦剌。西方也军乌兹克-哈萨克次并取得胜利。南也征服阿癿乞，使其归顺。

    然1503，阿黑麻汗军河被方联军所打败甚被俘，回阿克苏久就因病世，其曼苏尔继位。久，瓦剌乘机占领阿勒泰区并南占据了北疆东区。此达半世纪里，吐鲁番汗国和瓦剌争夺北疆，瓦剌从此正式当并始割据。

    汗国由此方割据状态，间发各战争布哈图也简略介绍了一番。此混局面一持续嘉靖期，当西区阿都·拉失德汗治理社稳定，经济化都有步。

    1559，阿都·拉失德汗世，经过一场残酷廷斗争，阿都·哈林继承汗位。阿都·哈林汗位期间，西区军事实力断稳固发展。

    此反，由从政力平庸，属众服，沙汗东区统治位则渐衰微。理各事务家族成员听调遣，各称雄。1566北征瓦剌死矢，沙汗叔伯速檀速继立为汗。

    东区一变故引起西阿都·哈林，速檀速刚刚台，阿都·哈林锁非速檀、黑麻速檀等借速檀速题(非察合台裔)，1570兵攻占吐鲁番区，俘获速檀速，扶立黑麻速檀为吐鲁番区首领。

    ，黑麻速檀等兄吐鲁番义遣使北京朝贡，建立了叶尔羌汗国联系。局面现也意味东察合台汗国东区此也为阿都·哈林治叶尔羌汗国所统一。

    位完成了汗国统一阿都·哈林病死，当布哈图还没打主意。然了，察哈尔局势危急，布哈图思索良久，为汉有句话得：“树挪死，挪活”，此察哈尔有西迁才获得一线机，因此才有了来蝉脱壳军西征默特。